實時熒光定量PCR儀百科知識
1. 定義與概述
實時熒光定量PCR儀(Real-Time?。眩酰幔睿簦椋簦幔簦椋觯濉。校茫?,?。瘢校茫遥┦且环N基于聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)技術(shù),通過熒光信號實時監(jiān)測DNA擴增過程的高精度分子生物學(xué)儀器。
核心功能:
定量檢測DNA/RNA的初始模板量(絕對定量或相對定量)。
檢測基因表達(dá)水平、病原體載量、基因突變等。
廣泛應(yīng)用于疾病診斷、基因研究、食品安全檢測等領(lǐng)域。
2. 核心技術(shù)原理
熒光標(biāo)記機制:
TaqMan探針法:探針帶有熒光基團和淬滅基團,擴增時探針?biāo)忉尫艧晒狻?/p>
SYBR Green法:染料嵌入雙鏈DNA發(fā)出熒光,成本低但特異性稍差。
分子信標(biāo)(Molecular Beacon):莖環(huán)結(jié)構(gòu)探針,靶序列結(jié)合后發(fā)光。
檢測模式:
終點法:僅檢測最終產(chǎn)物量。
實時法:通過Ct值(閾值循環(huán)數(shù))動態(tài)分析擴增曲線,實現(xiàn)精準(zhǔn)定量。
3. 核心參數(shù)與性能指標(biāo)
參數(shù) | 意義 | 典型范圍/要求 |
---|---|---|
檢測通道數(shù) | 支持多色熒光檢測能力(如FAM, HEX, ROX) | 1-6通道(多用于多重PCR) |
靈敏度 | 最低可檢測DNA拷貝數(shù) | 單拷貝(<10 copies/μL) |
溫控精度 | 溫度均一性和升降溫速率 | ±0.1°C,升降溫≥4°C/秒 |
動態(tài)范圍 | 線性定量范圍(Log值) | 7-8個數(shù)量級(10^1~10^8拷貝) |
4. 主要應(yīng)用場景
臨床診斷:
病毒/細(xì)菌核酸檢測(如新冠病毒、HPV、結(jié)核分枝桿菌)。
腫瘤基因突變檢測(EGFR、KRAS等)。
科研領(lǐng)域:
基因表達(dá)分析(mRNA定量)。
miRNA檢測、SNP分型。
農(nóng)業(yè)與食品:
轉(zhuǎn)基因成分鑒定。
食源性致病菌(如沙門氏菌)快速檢測。
5. 與傳統(tǒng)PCR的對比
特性 | 實時熒光定量PCR | 傳統(tǒng)PCR |
---|---|---|
定量能力 | 實時監(jiān)測,精準(zhǔn)定量(基于Ct值) | 僅終點定性/半定量(電泳分析) |
檢測速度 | 1-2小時(含數(shù)據(jù)分析) | 2小時+額外電泳時間 |
污染風(fēng)險 | 閉管操作,污染風(fēng)險低 | 開蓋電泳,易污染 |
成本 | 較高(熒光試劑/探針) | 低 |
6. 操作流程與注意事項
標(biāo)準(zhǔn)流程:
樣本制備:提取DNA/RNA并反轉(zhuǎn)錄為cDNA(RNA檢測時)。
反應(yīng)體系配制:加入引物、探針、模板、Taq酶等。
程序設(shè)置:設(shè)定擴增程序(預(yù)變性→循環(huán)擴增→熔解曲線分析)。
數(shù)據(jù)分析:通過軟件計算Ct值,生成標(biāo)準(zhǔn)曲線或相對表達(dá)量。
關(guān)鍵注意事項:
避免RNA降解(使用RNase抑制劑)。
防止交叉污染(分區(qū)操作、UNG酶防殘留)。
驗證引物特異性(熔解曲線單峰)。
7. 主流品牌與型號
品牌 | 代表型號 | 特點 |
---|---|---|
Bio-Rad | CFX96 | 高性價比,5通道檢測,適合中小型實驗室 |
Thermo?。疲椋螅瑁澹?/td> | QuantStudio 5 | 模塊化設(shè)計,支持高通量(384孔板) |
Roche | LightCycler 480 | 超快升降溫(19°C/秒),精準(zhǔn)溫控 |
Qiagen | Rotor-Gene?。?/td> | 離心式溫控,均一性好,適合低濃度樣本 |
8. 未來發(fā)展趨勢
數(shù)字化PCR(dPCR):通過微滴分區(qū)實現(xiàn)絕對定量,無需標(biāo)準(zhǔn)曲線。
便攜化設(shè)備:手持式qPCR儀(如BioFire FilmArray)用于床邊檢測。
AI整合:自動優(yōu)化引物設(shè)計、智能分析擴增異常曲線。
多重檢測升級:支持10+靶標(biāo)同步檢測(如病原體panel篩查)。
9. 常見問題(FAQ)
Q:是否必須做標(biāo)準(zhǔn)曲線?
A:絕對定量需要標(biāo)準(zhǔn)品繪制曲線;相對定量(如2^-ΔΔCt法)可不依賴標(biāo)準(zhǔn)曲線。Q:熔解曲線出現(xiàn)多峰怎么辦?
A:可能為引物二聚體或非特異擴增,需優(yōu)化引物濃度或退火溫度。Q:如何提高低濃度樣本的檢測靈敏度?
A:增加模板體積、使用高靈敏度探針(如TaqMan MGB)、減少抑制劑干擾。
總結(jié)
實時熒光定量PCR儀憑借高靈敏度、快速定量、閉管防污染等優(yōu)勢,已成為分子診斷和基因研究的核心技術(shù)平臺。隨著數(shù)字化、微流控等技術(shù)的融合,其在精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)和即時檢測(POCT)中的應(yīng)用將更加廣泛。
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